Dr. Aafia Siddiqui ble født 12.mars 1972 som en av tre søsken. Hun er datter av Muhammad og Ismet Siddiqui. Hennes far er lege med utdannelse fra England. Aafia er selv mor til tre barn.
Aafia flyttet til Texas i 1990 for bo nær sin bror. Etter et år ved University of Houston fikk hun plass ved det prestisjetunge MIT i Boston. Hun giftet seg med Muhammad Amjad Khan, den gang en medisinstudent, og fortsatte deretter sine studier ved Brandeis University i cognitive neuroscience. Hun avsluttet sine studier med en doktorgrad og var blant de fremste i verden i sitt felt.
Angrepene 11/9 gjorde livet vanskelig for muslimer i USA, og som mange andre valgte ekteparet å returnere til Pakistan. De bodde i Pakistan i en kort periode før de dro tilbake til USA. Her bodde de til 2002, før de igjen returnerte til Pakistan.
Ekteskapet mellom Aafia og hennes mann kom i hardt vær. De flyttet fra hverandre da Aafia var gravid i 8.mnd med sitt tredje barn. Aafia bodde med sin mor, mens hennes fraseparerte mann bodde et annet sted i byen Karachi. Da hennes nyfødte sønn var ett år valgte hun å flytte tilbake til USA i 2002 for å finne arbeid i området rundt Baltimore, der hennes søster allerede arbeidet ved Sinai Hospital.
Det var da Aafia var på besøk hos sin mor i Karachi at tragedien startet. Etter å ha sagt farvel til sin mor, tok hun med sine tre barn ut av Gulshan-e-Iqbal i Karachi på vei til flyplassen der hun skulle rekke et fly til Rawalpindi. Så langt kom hun ikke. Hun ble kidnappet av pakistansk etteretning og deretter levert til FBI. Aafia Siddiqui og hennes tre barn var borte. En uke etter bortføringen fikk hennes mor besøk av Pakistansk etteretning, som advarte henne mot å lage en stor sak ut av datteras forsvinning. Dette var en tid da offisielle både i Pakistan og USA nektet for å ha noe kjennskap til Aafia Siddiqui.
Det gikk ett år, og Afia Siddiqius bilde dukket opp på hjemmesiden til FBI, der hun ble beskrevet som terrorist i ledtog med al-Qaeda. Hun ble beskyldt for å ha en hånd med i spillet i en ulovlig diamanthandel i Liberia i 2001. I beskyldingen blir hun anklaget for å være på et bestemt sted i et tidsomfang på en uke. Aafias forsvarer, Elaine Whitfield Sharp, har bevist at Aafia i den aktuelle tidsperioden befant seg i Boston.
I Pakistan var det aldri en offentlig røst som spurte hvor Aafia Siddiqui hadde blitt av. 7.juli 2008 ble det arrangert en pressekonferanse i Pakistan i regi av Cageprisoners, der Yvonne Ridley og henne kollega Saghir Hussein satte søkelys på saken rundt Aafia. Det var med dette at saken kom frem i offentligheten. De politiske skuespillerne i Pakistan ble stilt til veggs, og media gjorde sitt få frem sannheten. Samme år, 3.august fikk Aafias bror i Houston besøk av FBI hvor han ble fortalt at hennes søster var en terrorist som ble holdt fanget i Bagram i Afghanistan. Noen dager senere sa amerikanske myndigheter at Aafia hadde blitt overført til USA.
Det blir hevdet fra amerikansk hold at hun ble arrestert 27.juli 2008 vandrende utenfor residensen til guvernøren i byen Ghazni i Afghanistan sammen med en gutt, utstyrt med terrormanualer og eksplosiver. Etter arrestasjonen skal hun ha avfyrt skudd mot en amerikansk soldat, men selv ha kommet til skade. Hun skal deretter ha blitt arrestert og blitt sendt til USA.
Britisk-pakistaneren Moazzem Begg ble tatt til fange av pakistansk etterretning i januar 2002. Han ble levert over til amerikanerne i Afghanistan som satte han i den bryktede Bagram-leieren før han ble sendt til Guantanamo. Etter å ha blitt løslatt i 2005 skrev han i sin bok Enemy Combatant om hvordan han og hans medfanger hørte høylytte kvinneskrik i fengselet. Moazzem trodde først amerikanerne hadde fanget hans egen kone for å ydmyke han, men byttet mening da han skjønte at dette ikke kunne være menneskeskrik. Fangene begynte å tro at amerikanerne spilte av høylytt kvinneskrik på høyttaler for å skremme fangene. De skjønte senere at dette var skrikene til Prisoner 650, Aafia Siddiqui.
Moazzem har i senere tid involvert seg for Aafia Siddiquis sak. En annen tidligere fange som led samme skjebne med Moazzem var britisk-etioperen Binyam Muhammad. Binyam Muhammad ble plassert i Bagram i juni 2004 og var der i tre til fire måneder før han ble flyttet til Guantanamo. I et intervju med Moazzem Begg forteller Binyam Muhammad om hvordan han så Aafia Siddiqui i Bagram i 2004. Hele intervjuet i sin helhet kan leses her:
http://www.andyworthington.co.uk/2009/03/28/guantanamo-bagram-and-the-dark-prison-binyam-mohamed-talks-to-moazzam-begg/
I følge flere rapporter skal hennes ene nyre samt en tarm ha blitt fjernet og tenner blitt knust. Hun skal også ha brukket nesen, som ble ”operert” på en amatørmessig måte. Aafia ble også påført et skudd, som ikke ble tilstrekkelig leget. Hennes mentale helse er ustabil eller flere år med tortur. Hennes forsvarere sier Aafias symptomer er identiske med en som lider av ”Post Traumatic Stress Disorder”. Hun har måttet dele både celle og dusj med menn, og har blitt utsatt for voldtekt av både amerikanske soldater og medfanger i flere år. Det er rapportert at hun lider av hjerneskade. Ved en episode under soning i New York skal hun ha blitt bakbundet, strippet og blitt laget videofilm av. 11.august 2008 meldte Reuters at hun ankom sin rettsak sittende i rullestol.
Aafia har flere ganger fremmet sitt ønske om ikke å møte opp i retten under rettsprossen, for å forhindre runder med ydmykende kroppsvisiteringer hver gang hun skal inn og ut av cellen. Det har hun ikke lykkes med. Hun er heller ikke tilfreds med sine forsvarere som hun har fått utpekt fra offisielt hold i USA og Pakistan. Fengselet der hun sitter i New York har flere ganger vært i medias søkelys for vold mot fanger:
http://www.nytimes.com/2007/04/13/nyregion/13guards.html?_r=1
- http://www.cageprisoners.com/articles.php?id=28946
- http://www.andyworthington.co.uk/2009/03/28/guantanamo-bagram-and-the-dark-prison-binyam-mohamed-talks-to-moazzam-begg/
- http://www.nation.com.pk/pakistan-news-newspaper-daily-english-online/Politics/21-Nov-2009/Dr-Aafia-to-boycott-trial
- http://www.harpers.org/archive/2009/11/0082719
- http://www.draafia.org
- http://ibrahimsajidmalick.com/aafia-siddiqui-says-she-is-not-anti-semetic/793
- http://pakistankakhudahafiz.wordpress.com/2010/01/20/dr-aafia-siddiqui-case-a-detailed-story-of-lies-and-deception-by-the-americans/